Eine der Hauptaufgaben des Naturschutzzentrums ist die fachliche Betreuung des Eriskircher Rieds, die in enger Zusammenarbeit mit dem Regierungspräsidium Tübingen und dem Landratsamt Bodenseekreis erfolgt. Hierbei steht vor allem die Pflege der naturkundlich besonders wertvollen Streuwiesen im Vordergrund. Um diese durch Jahrhunderte lange Nutzung geprägten Biotopflächen dauerhaft zu erhalten, müssen sie im Herbst und Winter gemäht werden. Praktische Erfahrungen der heimischen Landwirte und des Naturschutzbundes Deutschland sind uns bei der Organisation der Riedpflege eine große Hilfe.
Weitere wichtige Aufgaben bei der Betreuung des Schutzgebietes sind die Anlage von Kleingewässern für Amphibien und Wasserinsekten sowie die Besucherlenkung und -information. Drei Plattformen bieten optimale Möglichkeiten, die Vogelwelt am Seeufer zu erleben, ohne dass diese gestört wird. Große Tafeln informieren im Gelände über das Naturschutzgebiet. Von großer fachlicher Bedeutung ist die Erfassung und Dokumentation der Fauna und Flora sowie des Erfolgs der Pflegemaßnahmen. Besonders wertvoll sind jahrzehntelange Bestandserfassungen der Vogelwelt durch den Naturschutzbund Deutschland.